Program studi Ilmu Perikanan mempunyai tujuan untuk menghasilkan lulusan yang mempunyai pengetahuan dan keahlian di bidang budidaya perikanan dan pengolahan hasil perikanan, dan mencetak lulusan yang mempunyai jiwa wirausaha di bidang perikanan.

Wilayah Kabupaten Tuban yang berlokasi di pesisir pantai sangat mendukung adanya perkembangan di dunia perikanan. Beberapa matakuliah dalam perkuliahan di prodi ilmu perikanan sesuai dengan tujuan tersebut ( tercantum pada bab III), hal ini disesuaikan dengan kebutuhan perkembangan usaha di bidang perikanan dari waktu ke waktu.

Lulusan dari prodi Ilmu perikanan pada tahun akademi 2014/2015, dari 33 orang lulusan, bekerja di bidang perikanan (80%) dan di luar bidang perikanan (20%), masa tunggu lulusan untuk mendapatkan pekerjaan sekitar 1 bulan. Hal ini karena rata-rata mahasiswa prodi perikanan pada semester 6 sudah mulai mendapatkan/mempunyai pekerjaan.